Sietë molekulare të tipit Y kanë një strukturë gjashtëkëndore të paketuar të ngushtë të ngjashme me diamantin. Nëse kafazi beta përdoret si njësi strukturore për të zëvendësuar nyjet e atomit të karbonit të diamantit, dhe dy kafazet beta ngjitur janë të lidhura me kafaze kolone gjashtëkëndore, d.m.th., pesë kafazet e beta janë të lidhura së bashku me katër kafaze kolonare, nga të cilat një kafaz beta është i vendosur në qendër dhe katër kafazet e beta të vendosura në vertex të Tetrahedron, një oktahed cage zeol. është formuar. Duke vazhduar të lidhet me këtë strukturë, merret struktura e sitës molekulare të tipit Y. Në këtë strukturë, kafazi i madh i formuar nga kafazi β dhe kafazi kolonar gjashtëkëndor është një kafaz zeoliti me tetë anë, dhe vrimat e tyre të ndërlidhura të dritareve janë dymbëdhjetë unaza binare, madhësia mesatare e poreve efektive e të cilit është 0.74nm, e cila është madhësia e poreve të Sieve Molekulare të tipit Y. Sija molekulare e tipit x dhe struktura e sitës molekulare të tipit Y është saktësisht e njëjtë, por raporti i aluminit silic silicë të tipit Y është i lartë, stabiliteti hidrotermik është i fortë, kështu që përdoret më gjerësisht.
